Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vpreb3D3Z6J4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb3D3Z6J4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms