Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms