Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem200bD3Z0P8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms