Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc8D3YZV8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms