Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pnldc1B2RXZ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms