Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700018F24RikB2RW27 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700018F24RikB2RW27 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700018F24RikB2RW27 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700018F24RikB2RW27 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700018F24RikB2RW27 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700018F24RikB2RW27 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1700018F24RikB2RW27 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700018F24RikB2RW27 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700018F24RikB2RW27 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms