Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zkscan16A2ALW2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms