Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc163A2AGD7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc163A2AGD7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms