Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprfA2A8L5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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PtprfA2A8L5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms