Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Rhof-204ENSMUST00000186469 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 9130214F15Rik-201ENSMUST00000208727 1653 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Kif18b-201ENSMUST00000021311 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Slc25a13-201ENSMUST00000015256 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Nefm-201ENSMUST00000022638 3334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 D830044D21Rik-201ENSMUST00000143315 3897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Trcg1-201ENSMUST00000093837 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm38056-201ENSMUST00000193928 5027 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Limch1-203ENSMUST00000117601 3157 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 4430402I18Rik-208ENSMUST00000179171 2638 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Pcdhb7-201ENSMUST00000053037 3501 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm45515-201ENSMUST00000210796 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Mrpl15-206ENSMUST00000156816 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Prom1-214ENSMUST00000197706 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 AC122372.1-201ENSMUST00000215344 280 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr449-201ENSMUST00000050729 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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