Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms