Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Abhd3-201ENSMUST00000002549 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gimap8-201ENSMUST00000078223 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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H2-Eb1P04230 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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H2-Eb1P04230 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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H2-Eb1P04230 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Cmah-201ENSMUST00000050859 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 n-R5s51-201ENSMUST00000104473 123 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Swi5-202ENSMUST00000113395 712 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
H2-Eb1P04230 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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