Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd4Q9Z2D7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mbd4Q9Z2D7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms