Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Extl3Q9WVL6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Extl3Q9WVL6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms