Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l3Q9WTM4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l3Q9WTM4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l3Q9WTM4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l3Q9WTM4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l3Q9WTM4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l3Q9WTM4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2l3Q9WTM4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfe2l3Q9WTM4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2l3Q9WTM4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms