Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sema6cQ9WTM3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sema6cQ9WTM3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms