Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf346Q9R0B7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf346Q9R0B7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf346Q9R0B7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf346Q9R0B7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf346Q9R0B7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf346Q9R0B7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf346Q9R0B7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf346Q9R0B7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf346Q9R0B7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms