Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Map1aQ9QYR6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Map1aQ9QYR6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms