Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdzd4Q9QY39 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Pdzd4Q9QY39 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd4Q9QY39 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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