Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc5a3Q9JKZ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc5a3Q9JKZ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms