Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pard6bQ9JK83 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pard6bQ9JK83 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms