Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smpd3Q9JJY3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd3Q9JJY3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms