Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT0

Rcl1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcl1Q9JJT0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rcl1Q9JJT0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rcl1Q9JJT0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rcl1Q9JJT0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rcl1Q9JJT0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rcl1Q9JJT0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Rcl1Q9JJT0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Rcl1Q9JJT0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rcl1Q9JJT0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rcl1Q9JJT0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Rcl1Q9JJT0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rcl1Q9JJT0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rcl1Q9JJT0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms