Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc86Q9JJ89 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc86Q9JJ89 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms