Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ush1cQ9ES64 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ush1cQ9ES64 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms