Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr4Q9EP82 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr4Q9EP82 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms