Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tmem239Q9DA47 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem239Q9DA47 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem239Q9DA47 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem239Q9DA47 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem239Q9DA47 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem239Q9DA47 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem239Q9DA47 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem239Q9DA47 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem239Q9DA47 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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