Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnajc4Q9D844 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnajc4Q9D844 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms