Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9D7E4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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