Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt44Q9D2Q2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt44Q9D2Q2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms