Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snapc3Q9D2C9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snapc3Q9D2C9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms