Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TbcbQ9D1E6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TbcbQ9D1E6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms