Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc47Q9D024 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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