Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rrs1Q9CYH6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rrs1Q9CYH6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms