Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnnbl1Q9CWL8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnnbl1Q9CWL8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms