Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BccipQ9CWI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BccipQ9CWI3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms