Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smurf1Q9CUN6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smurf1Q9CUN6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms