Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhfpl3Q9CTN8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhfpl3Q9CTN8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms