Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sft2d3Q9CSV6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms