Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr3kQ9CQZ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Polr3kQ9CQZ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms