Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccer1Q9CQL2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccer1Q9CQL2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms