Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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