Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nudcd2Q9CQ48 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nudcd2Q9CQ48 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms