Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhe41Q99PV5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bhlhe41Q99PV5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms