Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim26Q99PN3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim26Q99PN3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim26Q99PN3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms