Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp16Q99LG0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp16Q99LG0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms