Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cds2Q99L43 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cds2Q99L43 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms