Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arrdc1Q99KN1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Arrdc1Q99KN1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms