Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pls3Q99K51 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pls3Q99K51 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms