Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc8b1Q925Q3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc8b1Q925Q3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms